1992年9月郭燕薇校長成為基新第六任校長。
1993年3月,擴校工程展開。擴校後,學校多了課室和特別室以開設更多科目,培養學生多方面的興趣。
學校亦透過靈修早會、團契聚會、福音周、福音營,讓學生認識真理;同時自1990年起設立「紀律雄師」計劃,通過小組活動、山野技能訓練、軍訓等,幫助一些缺乏成就感的學生重拾自信。
學業成績方面,翁校長致力推動學術發展,使基新學生學習成效顯著,多年來在公開試成績能夠持續進步,得到區內坊眾認可及支持,是以每年學校自行收生報名人數及中一叩門人數均大幅上升。
為建立基督化校園,翁校長上任後隨即在校內課室掛十字架、走廊掛上聖經金句,以營造宗教氛圍;2012年9月進行早會改革,每早早會學生均以頌唱詩歌開始,同誦主禱文結束;2013年,翁校長更進一步推動青少年福音事工,在初中外,更在高中增設聖經科,使全校學生都有學習聖經機會;同年更主動聯繫區會商議籌辦植堂事宜,發展至今,本校植堂堂會基新堂已剛過十周年堂慶。多年來,學校有宗教活動室、新天新地、宗教圖書館,為學生福音工作不遺餘力,實踐傳道服務精神。
此外,翁校長深信藝術能陶冶性情,發展潛能,因此到任後積極發展音樂工作,基新合唱團及管弦樂團先後於2012及2014年成立。學校開設不同樂器班,校方更斥資購買大量樂器,免費外借學生使用,希望培養學生的音樂造詣。多年來,基新合唱團和管弦樂團均有不少校內、校外演出機會,更曾到新加坡、馬來西亞、韓國及泰國交流演出,讓學生發展潛能外,也能拓闊視野。
2024年9月,翁港成校長調任區會基道中學,基新中學由高國榮博士接任成為第八任校長。高博士學識淵博,從事教育工作逾二十年,有豐富的教育與行政經驗,未來,將繼往開來帶領基新再創高峰。